Das Geheimnis ist ein wichtiges Element der freimaurerischen Symbolwelt, auch wenn es in der Freimaurerei weit weniger Geheimnisse gibt, als gemeinhin angenommen wird. Viele „Geheimnisse“ der Freimaurerei, bis hin zu den Inhalten der Freimaurerrituale, kann man mittlerweile in frei erhältlichen Büchern und im Internet nachlesen.
Geheim ist beispielsweise die Art, wie sich Freimaurer einander zu erkennen geben, um in der Öffentlichkeit nicht gleich als solche erkannt zu werden. Diese Tradition rührt aus der Tatsache, dass insbesondere in diktatorischen Regimen Freimaurer aufgrund ihrer liberalen Haltung immer wieder gedemütigt und verfolgt werden. Mit dem Geheimen einher geht die Verschwiegenheit, die als Tugend in der Freimaurerei eine wichtige Rolle spielt. Verschwiegenheit ist – wir kennen das alle aus echten Freundschaften – Basis für Vertrauen. Nur mit demjenigen, auf dessen Verschwiegenheit ich zählen kann, bespreche ich offen und ehrlich auch persönliche Angelegenheiten. Und Freimaurerei ist eine Form von gemeinsam praktiziertem und erlebtem Persönlichkeitstraining, beispielsweise in Form von Ritualen. Rituale, die in ihrer Wirkung durch eine Atmosphäre der Ruhe, des Vertrauens und der Verschwiegenheit intensiviert werden.
Das eigentliche „Geheimnis“ der Freimaurerei liegt jedoch in der intensiven Wirkung der Rituale. Dies ist ein Geheimnis, das sich weder zu Papier bringen noch in irgendeiner sonstigen Weise weitergeben lässt – es muss durch persönliches Erleben erlangt werden. Die Geheimnisse um die Freimaurerei geben leider immer wieder Anlass für Verschwörungstheorien, welche meist aus Unkenntnis resultieren und über die eigentlichen Ziele und Ideale der Freimaurer sowie deren positiven Wirkung auf die Gesellschaft hinwegtäuschen.